openMPI配置
最后更新于:2022-04-01 09:51:22
在所有的节点上,做下面的1—3操作
1,安装openmpi
http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.6/
之前系统默认带有openMPI,先把旧的删掉
2,配置无密码ssh登录:
请参考:[如何配置无密码SSH](http://hanhuzi.blogspot.com/2008/09/ssh.html)
3,在工作目录下编制配置文件(文件名随意),内容包括所有节点的名称,例如:
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#>cat hosts
host1 slots=4
host2 slots=4
host3 slots=4
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所有节点上的工作目录必需相同,配置文件名和内容也必需相同,简单的办法是所有节点的工作目录都mount到同一个nfs输出上
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在主节点上写程序并编译执行4—8
4,例子程序:
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[root@dhcp-beijing-cdc-10-182-120-155 ~]# cat hello.c
#include
#include "mpi.h"
int main(int argc, char *argv[])
{
int nproc;
int iproc;
char proc_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
int nameLength;
MPI_Init(&argc,&argv);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&nproc);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&iproc);
MPI_Get_processor_name(proc_name,&nameLength);
printf("Hello World, Iam host %s with rank %d of %d\n", proc_name,iproc,nproc);
MPI_Finalize();
return 0;
}
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5,编译这个例子:
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mpicc -o hello hello.c
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6,拷贝可执行文件hello到所有节点的相同工作目录(如果使用nfs可忽略此步)
7,执行hello
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#> mpirun -np 2 hello -hostfiles hosts
mpirun -hostfile ./hosts ./hello_cxx
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(上面的数字2代表在两个节点上运行hello)
此时,是不是已经看到了来自其它节点的问候?
8,当然,你可以用其他命令来替换hello比如:
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#> mpirun -np 3 ls -hostfiles hosts
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此命令在各节点上执行ls操作,并显示结果在主节点上。